Klasifikace zárodečných variant identifikovaných při genetickém vyšetření

Markéta Janatová, Štěpán Chvojka, Eva Macháčková, Jana Soukupová, Petra Zemánková, Petr Nehasil, Tomáš Zavoral, Lucie Hrušková, Mária Janíková, Klára Kozáková, Filip Lhota, Spiros Tavandzis, Petra Kleiblová, Zdeněk Kleibl

Klasifikace zárodečných variant identifikovaných při genetickém vyšetření

Číslo: 6/2023
Periodikum: Klinická onkologie
DOI: 10.48095/ccko2023431

Klíčová slova: hereditární nádorové syndromy – masivně paralelní sekvenování – genetické testování – klinická relevance – klasifikace variant – národní konsenzus

Pro získání musíte mít účet v Citace PRO.

Přečíst po přihlášení

Anotace: Východiska: Hereditární nádorové syndromy tvoří významnou podskupinu zhoubných nádorových onemocnění způsobených patogenními variantami v některém z mnoha známých nádorových predispozičních genů. Diagnostika nádorové predispozice je založena na genetickém testování pomocí sekvenování nové generace. To umožňuje analýzu mnoha genů najednou, nicméně zároveň se zvyšuje počet identifikovaných variant. Správná klasifikace nalezených variant je zásadní pro klinickou interpretaci výsledků genetického testování. Cíl: Cílem práce je shrnutí pravidel pro klasifikaci identifikovaných variant v rámci jednotlivých pracovišť a představení procesu tvorby společné klasifikace. Sdílení nalezených genetických variant a tvorba jejich konsenzuální klasifikace v rámci národních laboratorně diagnostických komunit probíhá v ČR v rámci konzorcia Czech Cancer Panel for Clinical Application (CZECANCA) sdružujícího výzkumné a diagnostické onkogenetické laboratoře. Tvorba konsenzu pro klasifikaci variant probíhá podle definovaného protokolu. Sdílení výsledků a konsenzuální klasifikace zrychluje a zpřesňuje vydávání výsledků genetického testování, harmonizuje výsledky mezi laboratořemi a přispívá tak ke zkvalitnění péče o jedince ve vysokém riziku vzniku nádorových onemocnění a jejich příbuzné.